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洁净实验室一般都是技术核心所在，关于建筑位置而言，建筑规模较大的学术类理化微生物等实验室条件允许的情况下尽量设置建筑单体（三级、四级生物安全防护实验室需要设置建筑单体），实验室的建筑要相对集中，与办公区、生产区等其他不同功能类用房分开，建立合理分区，分布在1小风频上风向。如果各类实验室集中在一个楼宇的，楼层上下应按照实验动物房、理化实验室、微生物。如果实验室和和其他业务行政等都集中在一个楼宇的，实验室一定要设在楼宇上部。
做好洁净空调系统的噪声控制
洁净空调系统的噪声不仅会让实验室工作人员产生厌烦情绪，还会对语言交流、仪器设备形成干扰，从而影响到整个实验项目的工作效率。当然，大量的噪声也势必会增加实验室的能耗。
虽然实验室内的噪声来源多种多样，但洁净空调系统或相关局部净化设备显然是产生噪声的大户。而至于噪声的大小，则与气流流型、换气次数相关，所以做好洁净空调系统的噪声控制至关重要。
如何才能做好洁净空调系统的噪声控制？具体来说，要在实验室装修时按照可持续发展的思路，淘汰高能耗的落后产品，而选择那些新型节能系统，这样能从源头上做好噪声控制。而对于已经在使用的老旧设备，建议在设备的气流通道上安装消声器。
空气调节系统：是洁净实验室-生物安全实验室安全运行的关键。由于洁净实验室-生物安全实验室内操作对象是危险性的微生物，对人体、动植物或环境具有危害，必须通过采用合理的空气调节系统，保持洁净实验室-生物安全实验室的相对负压环境无论何时都不被破坏，以保证实验室内危险性微生物不能向外部环境中扩散。空气调节系统必须可靠运行，采用先进技术，合理利用和节约能源与资源，保证环境的质量和安全，为实验人员提供所需要的温度和湿度，保障生物实验在安全的条件下进行，以确保实验结果得准确性。同时它还必须控制实验室的洁净度，对新风进行过滤，使实验室达到一定的净化要求。其中排风系统是重点，对于保证实验室相对负压环境和有效过滤室内污染排风起着重要的作用。
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